Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem47Q9JJG6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem47Q9JJG6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem47Q9JJG6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms