Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc86Q9JJ89 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms