Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FliiQ9JJ28 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FliiQ9JJ28 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FliiQ9JJ28 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms