Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EefsecQ9JHW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EefsecQ9JHW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EefsecQ9JHW4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms