Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RabggtaQ9JHK4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RabggtaQ9JHK4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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