Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sp6Q9ESX2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sp6Q9ESX2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms