Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Brd4Q9ESU6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Brd4Q9ESU6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Brd4Q9ESU6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms