Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rb1cc1Q9ESK9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms