Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ush1cQ9ES64 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ush1cQ9ES64 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ush1cQ9ES64 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms