Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube3bQ9ES34 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3bQ9ES34 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms