Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
V1ra8Q9EQ48 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms