Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl4Q9DCU6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl4Q9DCU6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms