Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa8Q9DCJ5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa8Q9DCJ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa8Q9DCJ5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa8Q9DCJ5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufa8Q9DCJ5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufa8Q9DCJ5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms