Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcaQ9DC61 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PmpcaQ9DC61 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PmpcaQ9DC61 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms