Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc97Q9DBT3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms