Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xrn2Q9DBR1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn2Q9DBR1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrn2Q9DBR1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms