Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ftsj3Q9DBE9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ftsj3Q9DBE9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms