Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf580Q9DB38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf580Q9DB38 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf580Q9DB38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf580Q9DB38 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf580Q9DB38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf580Q9DB38 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf580Q9DB38 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf580Q9DB38 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms