Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
1700018B08RikQ9DA83 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700018B08RikQ9DA83 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700018B08RikQ9DA83 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms