Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smco2Q9DA21 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smco2Q9DA21 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smco2Q9DA21 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms