Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcfc2Q9D968 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcfc2Q9D968 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms