Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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Gtf3c6Q9D8P7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Gtf3c6Q9D8P7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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