Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8N1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8N1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D8N1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms