Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmigd1Q9D7L8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmigd1Q9D7L8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmigd1Q9D7L8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms