Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf225Q9D7D1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf225Q9D7D1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf225Q9D7D1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms