Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tube1Q9D6T1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tube1Q9D6T1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms