Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc130Q9D516 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc130Q9D516 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms