Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3404Q9D506 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3404Q9D506 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms