Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf6Q9D4J7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms