Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc6Q9D4E6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc6Q9D4E6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms