Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syce1Q9D495 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce1Q9D495 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce1Q9D495 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms