Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D454 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D454 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D454 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D454 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D454 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D454 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D454 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D454 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D454 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D454 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D454 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D454 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D454 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D454 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D454 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D454 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D454 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D454 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D454 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D454 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D454 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D454 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D454 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D454 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D454 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D454 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D454 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D454 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D454 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D454 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9D454 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9D454 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9D454 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9D454 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D454 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D454 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D454 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D454 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D454 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D454 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Q9D454 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D454 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D454 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D454 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D454 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D454 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D454 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D454 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D454 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms