Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag1Q9D3E6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag1Q9D3E6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms