Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Urm1Q9D2P4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Urm1Q9D2P4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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