Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig1Q9D2J4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig1Q9D2J4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms