Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Batf3Q9D275 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Batf3Q9D275 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms