Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec13Q9D1M0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec13Q9D1M0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec13Q9D1M0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec13Q9D1M0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec13Q9D1M0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec13Q9D1M0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec13Q9D1M0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sec13Q9D1M0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sec13Q9D1M0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec13Q9D1M0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec13Q9D1M0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms