Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Elp3Q9CZX0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Elp3Q9CZX0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms