Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thumpd2Q9CZB3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thumpd2Q9CZB3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms