Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nip7Q9CXK8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nip7Q9CXK8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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