Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd12Q9CWU0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms