Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NubplQ9CWD8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NubplQ9CWD8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms