Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1bQ9CSU0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms