Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pard3bQ9CSB4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pard3bQ9CSB4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms