Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klhl28Q9CR40 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klhl28Q9CR40 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klhl28Q9CR40 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms