Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PompQ9CQT5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PompQ9CQT5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PompQ9CQT5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PompQ9CQT5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PompQ9CQT5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PompQ9CQT5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PompQ9CQT5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PompQ9CQT5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PompQ9CQT5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms