Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim8Q9CQQ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim8Q9CQQ0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms