Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Nicn1Q9CQM0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nicn1Q9CQM0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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