Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL5

Mrpl18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl18Q9CQL5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mrpl18Q9CQL5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mrpl18Q9CQL5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mrpl18Q9CQL5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mrpl18Q9CQL5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl18Q9CQL5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms