Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms